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酵母中反式DNA末端连接频率不受双链断裂预损伤空间邻近性的影响‘pg电子app’

发布时间:2021-09-28 00:02:02人气:
本文摘要:01文章背景概述BACKGROUNDINTRODUCTION双链断裂(DSBs)是一种相当严重的染色体受损,可造成基因组不平稳。

01文章背景概述BACKGROUNDINTRODUCTION双链断裂(DSBs)是一种相当严重的染色体受损,可造成基因组不平稳。真核细胞主要通过同源重组(HR)和非同源末端相连(NHEJ)两种机制来修缮DSBs。

从酵母到人类,每一种都是高度激进的。HR必须一个同源模板来构建修缮,而NHEJ则继续执行两个DSB末端必要相连。一般来说来说,完全相同的DSB末端相连在一起我们称作反式修缮(cis);两个有所不同的DSB末端出现异常相连在一起,我们称作反式修缮(trans)。

反式修缮不会造成染色体的重排,还包括易位、翻转、缺陷、放入和反复。对大多数自发性重排的牵头分析说明了了连接处的微同源性,指出它们一般来说是NHEJ的结果。然而,制止或增进具备多个DSB的细胞核中反式重排的因素却知之甚少。

最重要的是,反式和反式修缮在DSBs都代表确实的DNA修缮。因此,类似于倚赖rad52的机制可以同时展开同源重组和异位重组。依赖Ku家族DSB融合蛋白和DNA连接酶IV(酵母中的Dnl4)的联合机制可以催化剂反式和反式NHEJ事件。依赖DSB的诱变有可能各不相同细胞核中恶性肿瘤的空间产于,尤其是有所不同方位的DSB否某种程度有可能使其末端相连。

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Lisby等研究指出,在构成多个DSB后,在酿酒酵母中仅有仔细观察到两个Rad52病灶,指出每个病灶都挤满了好比一个DSB展开修缮。这解释DSB偏向于挤满,即挤满在一起展开修缮。

在内托核酸酶诱导后或在将细胞曝露于电离辐射后,哺乳动物细胞中也报导了DSB的聚类。有人指出DSB聚类是不利的,并不局限于相似的染色体结构域,因此空间邻近性足以说明DSB聚类。美国密歇根大学的ShamSunder和ThomasE.Wilson,2019年在《ProceedingsoftheNationalAcademyofSciencesoftheUnitedStatesofAmerica》(IF9.504,生物2区)公开发表为题“FrequencyofDNAendjoiningintransisnotdeterminedbythepredamagespatialproximityofdouble-strandbreaksinyeast”的研究。在这项工作中,作者们研究了同源DSB在酵母细胞核中的比较方位如何影响反式DSB修缮频率。

本研究主要专心于准确的NHEJ以及类似于MMEJ的SSA(singlestrandannealing)事件。在构成多个DSB之后,反式修缮高于反式修缮,但反式修缮效率与所报导的核内DSB位点的预受损空间附近性明显牵涉到。这些找到与DSB的固定化和有可能的区域化修缮是完全一致的。这些找到与DSB被挤满并有可能被拆分以展开修缮是完全一致的。

02所用到的主要方法METHODS1.基因组重排测量NHEJ、SSA和HR修缮实验。2.竞争实验3.认识频率的计算出来4.DSB修缮结果分析03文章主要内容摘要ABSTRACTDNA双链断裂(DSBs)是相当严重的基因组受损,如果错误修缮不会造成染色体的重排。为了了解理解促使这些重排的核机制,本研究在酵母中研发了一种对于大多数仪器的非同源末端相连(NHEJ)的测量修缮的方法,还包括反式(完全相同位点)和反式(有所不同位点)的修缮。

在测量中,HO内托酶基因置放两个HO切割成位点之间,这样在诱导HO内托酶传达后可以自我中止。更进一步在有所不同的基因组位点上摆放了一个额外的剪切位点,这样反式修缮可造成LEU2报告基因的传达。与之前的研究完全一致,反式NHEJ比反式NHEJ更加有效地。

然而,与同源重组有所不同,单个DSB与供体基因座之间的空间距离与修缮效率涉及;而无论两个DSB基因座的方位如何,即使当两个反式修缮具备竞争关系时,反式NHEJ频率基本维持恒定。通过较短的必要反复序列经单链热处理修缮(SSA)类似于的DSBs,修缮效率和反式修缮频率都明显提升,但依然没反式修缮与基因组方位的强劲相关性。

本研究结果表明多个DSB修缮受实受损空间邻近性的影响。


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